泉州医学高等专科学校药学专业设置于2003年，为我校重点建设专业，2010年被评为省级精品专业，2013年被评为省级示范专业。专业核心课程《药理学》、《药物制剂技术》2门课程被评为省级精品课程。自2007年起，药学院与东南医药集团联合办学，举办药学专业东南医药教学班，建立厂中校，实现“深度校企合作，全程职业模拟”的人才培养模式改革与创新。该项目2010年通过省教育厅立项，2014年获省教学成果奖二等奖。

   药学专业旨在培养具有良好公民修养和职业生涯发展能力，并具有良好的职业素质和药学专业理论、专业技能，毕业后在社区医学和新农村合作医疗卫生机构、药企、药政管理和药品质量检测鉴定等部门从事药品调剂、药剂制备、药物质量分析检验、药学信息收集反馈、临床药学技术服务和药品营销流通等岗位工作的技术技能型药学人才。